În mod tradițional, se crede că sunetul tunetelor din mulți munți și văi din Bhutan este vocea dragonilor, iar țara este cunoscută sub numele de „Țara dragonului tunetelor” în limba sa maternă. Cu toate acestea, designul dragonului steagului ar fi putut fi influențat de modele similare folosite de secole de către chinezii vecini. În ghearele sale, dragonul de pe steag apucă bijuterii, stând pentru bogăția națională și pentru desăvârșire. Dragonul, care era inițial verde, este acum alb, simbolizând puritatea și loialitatea diferitelor grupuri etnice din țară. Culoarea galben-portocaliu, pe care guvernul butanez o descrie oficial ca fiind galbenă, este simbolică pentru puterea regelui, în calitate de șef al guvernului secular, în timp ce portocaliu-roșu este asociat cu Bka'-brgyud-pa (Kagyupa) și Rnying-ma-pa (Nyingmapa) secte budiste și cu angajamentul religios al națiunii.
Nu se cunoaște data exactă a introducerii acestui pavilion, dar poate s-a produs în 1971, când Bhutan a aderat la Națiunile Unite. Până în anii’60 Bhutanul a fost în mare parte închis lumii exterioare; relațiile sale externe au fost realizate prin Regatul Unit (1910–49) și prin India (din 1949 până în anii’60). Izolarea și lipsa unui litoral din Bhutan au limitat strict circumstanțele în care era necesar un steag național.
