Biogeochimia, studiul comportamentului elementelor chimice anorganice în sisteme biologice cu scop geologic, spre deosebire de geochimia organică, care este studiul compușilor organici găsiți în materialele geologice și în meteoriți, inclusiv pe cei cu origine biologică problematică. Subiectele care sunt clasificate în biogeochimie și geochimie organică includ originea petrolului, originea vieții, compoziția atmosferelor primitive, prospectarea bihochimică a depozitelor minerale, originea anumitor depozite de minereu, chimia apelor naturale, formarea solului și chimia de cărbune. Aproape toate procesele geologice care apar la suprafața Pământului sunt afectate de activitatea biologică.
